我國(guó)分析儀器的軟件研發(fā)相對(duì)比儀器制造更加落后，如我國(guó)引進(jìn)的某些分析儀器至今還采用十幾年前的系統(tǒng)軟件。我國(guó)至今沒有建立分析儀器數(shù)據(jù)的格式標(biāo)準(zhǔn)；近年來(lái)在中國(guó)軟件版權(quán)登記中心登記具有知識(shí)產(chǎn)權(quán)的軟件主要是（財(cái)務(wù)、企業(yè)等）管理軟件與游戲軟件，沒有見到具有獨(dú)立知識(shí)產(chǎn)權(quán)的分析儀器系統(tǒng)軟件，更沒有開發(fā)工具軟件。

　　
我國(guó)分析儀器企業(yè)在軟件的研發(fā)上存在很多困難：
　　
1.分析儀器的軟件開發(fā)需要多方面的人才和知識(shí)基礎(chǔ)。如開發(fā)一個(gè)近紅外分析軟件除了需要較高水平的軟件工程人員外，還要光譜學(xué)、光譜儀器學(xué)、化學(xué)計(jì)量學(xué)算法、樣晶資源、化學(xué)分析等專業(yè)人員。軟件提供給用戶后還需要軟件維持、模型的轉(zhuǎn)移、修改的專業(yè)人員，這是我國(guó)目前分析儀器廠家所難以承受的。
　　
2.由于我國(guó)軟件的價(jià)值逐步提高，軟件開發(fā)人員缺乏。此外，我國(guó)現(xiàn)有的知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)辦法不夠完善，軟件人員的價(jià)值不能充分體制。一般分析儀器廠家無(wú)法穩(wěn)定軟件專業(yè)人員，人員流失嚴(yán)重。
　　
3.我國(guó)分析儀器的軟件基礎(chǔ)相當(dāng)薄弱，缺乏相應(yīng)的開發(fā)工具軟件，所有的編程幾乎都要從頭做起。
　　
4.對(duì)分析儀器中軟件作用的認(rèn)識(shí)還不統(tǒng)一，甚至還有人認(rèn)為“搞軟件不花錢”，“軟件開發(fā)經(jīng)費(fèi)不足”。
　　
“十五”計(jì)劃中應(yīng)注意支持分析儀器的軟件研發(fā)和產(chǎn)業(yè)化
　　鑒于軟件在現(xiàn)代分析儀器中的作用與目前分析儀器軟件開發(fā)基礎(chǔ)薄弱，現(xiàn)有的企業(yè)難以完成高水平分析儀器的軟件開發(fā)。國(guó)家應(yīng)在“十五”計(jì)劃中重點(diǎn)支持分析儀器基礎(chǔ)軟件的研發(fā)和產(chǎn)業(yè)化，由此產(chǎn)生的經(jīng)濟(jì)效益將是巨大的。并由此可能開發(fā)具有我國(guó)特點(diǎn)的小型智能分析儀器，這將對(duì)我國(guó)一些產(chǎn)業(yè)部門如農(nóng)業(yè)部門產(chǎn)生重要的作用。
　　
國(guó)家對(duì)分析儀器軟件開發(fā)的支持可以包括：
　　首先，國(guó)家組織力量，聯(lián)合攻關(guān)，建立我國(guó)分析儀器軟件的標(biāo)準(zhǔn)，如數(shù)據(jù)的格式標(biāo)準(zhǔn)、分析儀器數(shù)據(jù)庫(kù)的標(biāo)準(zhǔn)、分析儀器通訊協(xié)議的標(biāo)準(zhǔn)等。作為發(fā)展我國(guó)分析儀器軟件的基礎(chǔ)。
　　
其次，國(guó)家在“十五”計(jì)劃中投資支持“產(chǎn)、學(xué)、研”，組織力量，聯(lián)合攻關(guān)，研究、開發(fā)分析儀器的基礎(chǔ)軟件，包括基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)、分析儀器軟件基礎(chǔ)組件庫(kù)（包括分析儀器基礎(chǔ)硬件的驅(qū)動(dòng)程序、基礎(chǔ)的數(shù)學(xué)算法包括矩陣運(yùn)算、統(tǒng)計(jì)運(yùn)算等，以及儀器分析的化學(xué)計(jì)量學(xué)算法、分析數(shù)據(jù)的前處理算法、分析結(jié)果的報(bào)表生成、圖譜輸出等分析儀器通用的基礎(chǔ)組件）；此外國(guó)家應(yīng)支持開發(fā)建立適合我國(guó)儀器行業(yè)進(jìn)行軟件二次開發(fā)的平臺(tái)。各分析儀器企業(yè)可以充分利用國(guó)家應(yīng)投資支持開發(fā)的分析儀器基礎(chǔ)軟件，可以根據(jù)需要按一定的方式方便地得到開發(fā)平臺(tái)，作為軟件開發(fā)工具，應(yīng)用基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)和組件庫(kù)的有關(guān)組件，只要另行開發(fā)一些專用的組件，進(jìn)行系統(tǒng)集成，就可完成企業(yè)自己軟件的開發(fā)。由于企業(yè)的軟件開發(fā)人員可以利用軟件開發(fā)工具與大量基礎(chǔ)組件，大大降低了軟件開發(fā)的工作量與開發(fā)成本，開發(fā)出高水平的軟件，提高儀器的水平。按這樣的運(yùn)做方式：國(guó)家投資，分析儀器全行業(yè)得益，提高儀器分析行業(yè)的整體水平。

此外，應(yīng)成立一些非盈利為目標(biāo)的開發(fā)服務(wù)中心，運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)技術(shù)，通過(guò)遠(yuǎn)程分析、遠(yuǎn)程教學(xué)、遠(yuǎn)程診斷等遠(yuǎn)程服務(wù)方式，提供必要的數(shù)據(jù)、技術(shù)、模型，幫助企業(yè)開發(fā)分析儀器軟件、幫助儀器軟件的用戶用好儀器與軟件。軟件的競(jìng)爭(zhēng)主要是人才的競(jìng)爭(zhēng)，在軟件人才的引入與穩(wěn)定方面各單位應(yīng)給予支持。